公元前210年，秦始皇崩。宦官赵高、公子胡亥、重臣李斯三人联合篡改始皇帝旨意，伪造始皇帝诏书，命令再上郡军中的公子扶苏即刻自尽。主角在公子扶苏自尽那刻穿越而来。主角从后世来，知道这是赵高搞的矫诏，听从了蒙恬的谏言。为了抗衡胡亥势力，主角在蒙恬协助下，稳定上郡军心，开始种田，猥琐发展上郡及长城沿线。主角为了后续的发展，在上郡设安北都护府，领地在长城沿线以及长城以北地区。安北都护府颁布了开荒屯田政策。吸引隐士，吸收流民，吞并游牧民。同时开始进行上郡城的建设。主角施展有别于始皇帝的政策，纠正始皇帝操之过急的政策，矫正过于激进的国策，部分恢复分封制。将众兄弟姐妹分封到安北都护府下辖各地建立封国。历史的车轮不可更改，胡亥依旧登上了大秦二世皇位。但胡亥对扶苏万分忌惮，准备发兵讨伐扶苏。扶苏在蒙恬辅佐之下，整军备战。扶苏心怀仁慈，不忍手足相残，从而给初立的大秦帝国带来大规模杀伐。只防不攻。与胡亥派来的大军形成对峙局面。
